Insgesamt finden sich in Bayern 12 Universitäten. An diesen studieren rund 240.000 Studenten. Die größte Universität Bayerns ist die Ludwig-Maximilians Universität München. Mit über 50.000 Studenten ist sie zudem die zweitgrößte Universität Deutschlands.
Die Universitäten Bayern gehören außerdem zu den bedeutendsten und besten der Bundesrepublik Deutschland. Die Uni Würzburg etwa wurde bereits im Jahr 1402 gegründet und zählt somit zu den vier ältesten Universitäten Deutschlands. Neben dieser jahrhundertealten Tradition können die Universitäten Bayerns besonders mit ihrem hohen Standard und der Bildungsqualität punkten. Die Technische Universität München (TUM) zählt zu den ersten drei Exzellenz-Universitäten Deutschlands und hat bisher 17 Nobelpreisträger ausgebildet. Aus der Universität Würzburg gingen in ihrer Geschichte bereits 8 Nobelpreisträger hervor. Und die Universität Bayreuth zählt zu einer der angesehensten Universitäten Deutschlands.